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さきほどつぶやいたScallopの比較対象の一つになっていたGenome-guided transcriptome assembler “TransComb”。さっきの論文ではStringTieに負けていたが、こちらではStringTieより良いよっていっている・・・。自分のデータで比較してみないと何がいいかわからんね。 https://t.co/CR5cGQJ8Jn
さきほどつぶやいたScallopの比較対象の一つになっていたGenome-guided transcriptome assembler “TransComb”。さっきの論文ではStringTieに負けていたが、こちらではStringTieより良いよっていっている・・・。自分のデータで比較してみないと何がいいかわからんね。 https://t.co/CR5cGQJ8Jn
They are however a bit short on tools for transcript reconstruction tools according to: https://t.co/n3XwTaY7iH
TransComb: genome-guided transcriptome assembly via combing junctions in splicing graphs. https://t.co/OWBZsZoj8S
RT @GenomeBiology: Jiang, Li &co present a method for #transcriptome assembly using weighted junction graphs https://t.co/pzlsJy0m3a